Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFRLQ15198 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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