Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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