Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAPTM4AQ15012 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms