Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms