Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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