Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms