Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms