Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
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