Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPM6BQ13491 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPM6BQ13491 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms