Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMQ13315 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMQ13315 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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