Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms