Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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