Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms