Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms