Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms