Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCBP1Q09161 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms