Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms