Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms