Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNC1Q01954 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms