Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms