Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms