Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRX1P78414 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRX1P78414 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms