Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5BP61020 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5BP61020 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5BP61020 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5BP61020 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5BP61020 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5BP61020 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RAB5BP61020 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB5BP61020 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5BP61020 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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