Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms