Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ATP5EP56381 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms