Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP98P52948 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP98P52948 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP98P52948 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP98P52948 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms