Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB27AP51159 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms