Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms