Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms