Protein–RNA interactions for Protein: P42568

MLLT3, Protein AF-9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLLT3P42568 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLLT3P42568 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLLT3P42568 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLLT3P42568 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLLT3P42568 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MLLT3P42568 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MLLT3P42568 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms