Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms