Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms