Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRS3P32247 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRS3P32247 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms