Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKBRP32239 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms