Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms