Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms