Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAP3P28838 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAP3P28838 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LAP3P28838 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAP3P28838 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAP3P28838 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms