Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms