Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTX3P26022 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms