Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCP25054 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCP25054 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APCP25054 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCP25054 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCP25054 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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