Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms