Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms