Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASTP20810 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASTP20810 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CASTP20810 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASTP20810 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASTP20810 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASTP20810 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms