Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGCP20142 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGCP20142 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGCP20142 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms