Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms