Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms