Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA1P15085 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA1P15085 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPA1P15085 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPA1P15085 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA1P15085 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA1P15085 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms