Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIP12755 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIP12755 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIP12755 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIP12755 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIP12755 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIP12755 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIP12755 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms