Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms