Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI3P10071 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI3P10071 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms